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一份南海深海沉積物樣品中可培養(yǎng)細(xì)菌的多樣性

陳柔雯; 王可欣; 何媛秋; 田新朋; 龍麗娟 中國科學(xué)院南海海洋研究所中國科學(xué)院熱帶海洋生物資源與生態(tài)重點實驗室; 廣東省海洋藥物重點實驗室; 中國科學(xué)院海洋微生物研究中心; 廣東廣州510301; 中國科學(xué)院大學(xué); 北京100049

摘要:海洋沉積環(huán)境蘊含豐富的微生物資源。對深海難培養(yǎng)微生物的分離培養(yǎng),不僅有利于深海微生物資源的挖掘與利用,也有利于對深海微生物學(xué)的研究。本研究采用多種培養(yǎng)基分離獲得細(xì)菌菌株純培養(yǎng),并通過16S r RNA基因序列鑒定,對我國南海海域1個4 000 m水深的深海表層沉積物樣品的可培養(yǎng)細(xì)菌多樣性進行初探。共設(shè)計23種分離培養(yǎng)基,經(jīng)過選擇性分離培養(yǎng)最終獲得612株細(xì)菌菌株,分別隸屬于厚壁菌門(Firmicutes)、放線菌門(Actinobacteria)和擬桿菌門(Bacteroidetes)的9目10科27個屬級類群,可培養(yǎng)優(yōu)勢類群為厚壁菌門,占所有分離物種數(shù)量的85.8%,包含13個16S r RNA基因序列相似性低于98%的潛在新物種。海洋瓊脂類培養(yǎng)基適合培養(yǎng)不同種類的海洋細(xì)菌類群,放線菌選擇性分離類合成培養(yǎng)基對放線菌類群的分離效果較好。最終獲得一些與具有產(chǎn)抗生素、細(xì)胞毒素、高效酶活、耐受不良環(huán)境、降解污染物等特殊功能微生物相近的菌株。研究結(jié)果表明,該深海沉積物樣品的可培養(yǎng)微生物資源、潛在新物種和微生物生理特性豐富多樣,研究深海環(huán)境難培養(yǎng)微生物的分離策略及其微生物適應(yīng)生理特性對研究極端環(huán)境微生物打下了基礎(chǔ)。

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