一份南海深海沉積物樣品中可培養細菌的多樣性
摘要：海洋沉積環境蘊含豐富的微生物資源。對深海難培養微生物的分離培養,不僅有利于深海微生物資源的挖掘與利用,也有利于對深海微生物學的研究。本研究采用多種培養基分離獲得細菌菌株純培養,并通過16S r RNA基因序列鑒定,對我國南海海域1個4 000 m水深的深海表層沉積物樣品的可培養細菌多樣性進行初探。共設計23種分離培養基,經過選擇性分離培養最終獲得612株細菌菌株,分別隸屬于厚壁菌門（Firmicutes）、放線菌門（Actinobacteria）和擬桿菌門（Bacteroidetes）的9目10科27個屬級類群,可培養優勢類群為厚壁菌門,占所有分離物種數量的85.8%,包含13個16S r RNA基因序列相似性低于98%的潛在新物種。海洋瓊脂類培養基適合培養不同種類的海洋細菌類群,放線菌選擇性分離類合成培養基對放線菌類群的分離效果較好。最終獲得一些與具有產抗生素、細胞毒素、高效酶活、耐受不良環境、降解污染物等特殊功能微生物相近的菌株。研究結果表明,該深海沉積物樣品的可培養微生物資源、潛在新物種和微生物生理特性豐富多樣,研究深海環境難培養微生物的分離策略及其微生物適應生理特性對研究極端環境微生物打下了基礎。
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