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阿壩藏雞三個品系線粒體DNA編碼分析

楊小林; 何世明; 吳錦波; 余春林; 楊朝武; 王蓉芳; 蘇元君; 李星亮 阿壩藏族羌族自治州畜牧科學技術研究所; 四川紅原624402; 四川省畜牧科學研究院; 四川成都610066; 茂縣九頂原生態畜禽養殖有限責任公司; 四川茂縣623200

摘要:試驗旨在通過對阿壩藏雞三個品系進行深入研究,利用COX1和D-LOOP基因某一特定區段作為DNA條形碼對阿壩藏雞三個品系進行分子鑒定,分析其遺傳多態性并探討DNA條形碼在藏雞分支鑒定工作的可行性和有效性。以阿藏1系、阿藏2系、阿藏3系三個品系作為研究對象,利用DNA測序技術測定了COX1和D-LOOP基因的部分序列。兩基因在三個品系的單倍型數量、平均核苷酸差異數(K)均不相同,阿藏3系的平均核苷酸差異數高于阿藏1系和阿藏2系;三個品系核苷酸多態度(Pi)相差不大,其中阿藏2系COX1基因核苷酸多態度略高于其他兩品系。三個品系內COX1和D-LOOP兩基因測算得出的遺傳距離分別為2.21~2.40、4.02~4.34,且各品系間相差不大。通過構建兩基因的UPGMA樹顯示,三品系間存在一定程度的基因交流。利用COX1和D-LOOP基因某一特定區段作為DNA條形碼的基礎,各有其優勢特點,兩基因工具搭配使用可提高品系鑒定的準確性。

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