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谷子膜結(jié)合脂肪酸脫氫酶基因家族的鑒定及進化分析

李鳳; 鄭汪東; 唐文博 山西大同大學生命科學學院; 山西大同大學設施農(nóng)業(yè)技術(shù)研發(fā)中心; 山西大同037000

摘要：以谷子基因組數(shù)據(jù)庫為平臺,借用生物信息學手段,對谷子膜結(jié)合脂肪酸脫氫酶(FAD)基因家族進行全基因水平上的鑒定及進化分析。結(jié)果表明,谷子中含有9個膜結(jié)合FAD成員,通過與擬南芥和水稻的膜結(jié)合FAD成員一起構(gòu)建進化樹,將其劃分成4個亞家族,并發(fā)現(xiàn)第一類脫氫酶亞家族的基因在谷子中發(fā)生了缺失。此外,谷子膜結(jié)合FAD中各個亞家族的基因結(jié)構(gòu)表現(xiàn)出一定的保守性,并且這種保守與其進化關(guān)系高度吻合;谷子中僅發(fā)現(xiàn)1對膜結(jié)合FAD復制基因SiFAD3.1/SiFAD3.2,且該次基因復制事件屬于片段復制。研究結(jié)果可為谷子膜結(jié)合FAD家族的鑒定及分子進化研究提供重要的理論依據(jù)。

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