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MBL2與MASPs家族蛋白質(zhì)相互作用的生物信息學(xué)分析

程少文; 陳揚(yáng)平; 張安強(qiáng); 彭磊; 梁華平; 呂傳柱 海南醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院創(chuàng)傷中心; 海南海口570102; 急救與創(chuàng)傷研究教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室; 海南海口571199; 陸軍軍醫(yī)大學(xué)大坪醫(yī)院野戰(zhàn)外科研究所; 創(chuàng)傷、燒傷與復(fù)合傷國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室; 重慶400042; 海南醫(yī)學(xué)院急診創(chuàng)傷學(xué)院; 海南海口571199

摘要：目的:通過生物信息學(xué)方法對甘露糖結(jié)合凝集素2(MBL2)蛋白與甘露聚糖結(jié)合凝集素相關(guān)絲氨酸蛋白酶(MASPs)家族蛋白質(zhì)的相互作用進(jìn)行全面預(yù)測分析。方法:使用同源建模(Swiss-model)和折疊識別(Phyre2)分別來構(gòu)建MBL2蛋白與MASPs家族蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu),使用STRING數(shù)據(jù)庫及ZDOCK3.02預(yù)測分析MBL2與MASP1、MASP2兩個(gè)蛋白質(zhì)的相互作用情況。結(jié)果: MBL2與MASP1和MASP2均存在直接相互作用,并且和COLEC11、COLEC10、FCN2、C4B等構(gòu)成相互作用網(wǎng)絡(luò)。MBL2與MASP1結(jié)合位點(diǎn)和MASP2的結(jié)合位點(diǎn)高度重疊。MBL2參與結(jié)合MASP1的殘基,大部分(77%)也參與了與MASP2的結(jié)合,表明MBL2是通過同一個(gè)區(qū)域,分別與MASPs家族的蛋白質(zhì)相互作用。結(jié)論: MBL2與MASPs家族蛋白質(zhì)之間作用密切,從而可能在補(bǔ)體系統(tǒng)激活及機(jī)體免疫防御等方面發(fā)揮重要的作用。

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