利用重測序–BSA分析鑒定金柑油胞發育相關基因
摘要：為了鑒定與金柑油胞發育相關的基因,用多油胞的羅紋金柑[Fortunella japonica(Thunb.)Swingle,母本]和少油胞的滑皮金柑(Fortunella crassifolia Swingle‘Huapi’,父本)進行雜交構建了F1代分離群體,從159個F1代單株中挑選出高油胞密度和低油胞密度的單株各30株,分別構建兩個極端性狀的DNA混池用于基因組重測序。利用重測序數據結合混合分組分析法(Bulked Segregant Analysis,BSA)進行遺傳關聯性分析,將控制油胞數量性狀的位點定位在第9條染色體的25 980 001~29 160 001 bp的區域內。該區域包含511個有效的SNP,分布在301個基因位點上。同源性功能分析后獲得11個與細胞程序性死亡、細胞壁功能和結構及細胞伸長和膨大等生理過程相關的候選基因(Ciclev10005243m.g、Ciclev10005288m.g、Ciclev10005338m.g、Ciclev10005441m.g、Ciclev10006448m.g、Ciclev10005804m.g、Ciclev10004719m.g、Ciclev10005888m.g、Ciclev10006502m.g、Ciclev10005197m.g和Ciclev10004431m.g),這些基因可能在柑橘油胞的發育過程中起重要作用。
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