肺癌中SOX4基因的調控網絡分析驗證和蛋白質預測
摘要：目的：分析SOX4基因的調控網絡和蛋白產物特征,并進行驗證。方法：利用生物信息學方法預測人SOX4基因的調控網絡及其蛋白產物與其他蛋白的相互作用;在肺癌細胞系和肺癌臨床樣本中通過實時熒光定量PCR對mi RNA-30s進行定量分析。結果：人類SOX4蛋白可能與TP53、DICER1和SDCBP2等3種蛋白相互作用;SOX4基因可能受多種lnc RNA和mi RNA的調控;hsa-mi R30s在臨床樣本中表達模式不完全相同。與癌旁組織相比,hsami R30c-5p和hsa-mi R30d-5p在癌組織中顯示低表達,hsa-mi R30d-5p則相反;與正常人胚肺成纖維細胞KMB17相比,肺癌細胞系A549和H1299中3個mi RNA-30成員的表達模式均為高表達。結論：SOX4基因及其蛋白產物的生物信息學分析為相關研究提供了重要信息基礎,但尚須相關實驗驗證,以確定相關性。
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