利用RNA-Seq技術篩選腦血流自動調節相關基因
摘要：目的利用RNA-Seq技術篩選并分析與腦血流自動調節相關的基因。方法健康雄性SD大鼠隨機分為高血壓模型組（14只）和假手術組（6只）,高血壓模型組大鼠進行雙側腎動脈夾閉,假手術組行開腹手術,不夾閉腎動脈。術后8周將大鼠麻醉,以10～15 mm Hg為一級降低血壓,同步記錄股動脈血壓、頸動脈血流量以及大腦中動脈血流速度,繪制自動調節曲線,并計算腦血流自動調節下限（lower limit of autoregulation,LLCA）。其后取大鼠腦組織進行轉錄組測序（RNA sequencing,RNA-Seq）,比較兩組基因表達差異。根據LLCA升高程度將模型組分為兩個亞組,高LLCA亞組與低LLCA亞組,高LLCA與假手術組篩選差異表達基因。結果完整采集數據模型組6只,假手術組3只。模型組收縮壓、平均動脈壓以及LLCA均顯著高于假手術組（P〈0.05）。模型組中高LLCA亞組與低LLCA亞組收縮壓、平均動脈均無明顯差異,但高LLCA組的LLCA值高于低LLCA組,差異具有統計學意義（P〈0.05）。模型組與假手術組相比有45條基因差異表達,其中上調基因30條,下調基因15條,高LLCA亞組與假手術組比較有478條基因差異表達,其中上調基因289條,下調基因189條。兩兩比較的交集差異基因共有38條,功能主要涉及趨化作用、平滑肌細胞分化、肌管細胞發育、整聯蛋白介導的信號通路等。結論高血壓大鼠與正常大鼠共有45條基因差異表達,其中高LLCA的高血壓大鼠有478條基因表達發生變化。
注: 保護知識產權,如需閱讀全文請聯系血栓與止血學雜志社
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