多形性膠質母細胞瘤相關miRNAs的鑒定與分析
摘要：目的篩選多形性膠質母細胞瘤(glioblastoma multiforme,GBM)相關的miRNAs并進行生物信息學分析。方法從基因表達數據庫(gene expression omnibus,GEO)中下載芯片數據集GSE65626,采用BRB-Array Tools鑒定差異表達miRNAs。利用miRanda和TargetScan在線工具預測差異表達miRNAs的靶基因,然后對靶基因進行基因本體(gene ontology,GO)功能富集分析和通路富集分析,并構建miRNA-Gene互作網絡。結果從GBM組織和瘤旁組織之間共篩選出128個差異表達miRNAs,其中61個上調表達,67個下調表達。GO功能富集分析表明差異表達miRNAs的靶基因主要涉及轉錄調控、信號傳導、軸突導向、細胞粘附、細胞增殖與凋亡調控等生物過程。通路富集分析發現靶基因顯著富集于磷脂酰肌醇3-激酶(phosphatidylinositol-3-kinase,PI3K)-Akt信號通路、粘著斑、細胞骨架調節、絲裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)信號通路、軸突導向等通路。miRNA-Gene互作網絡分析鑒定的核心miRNAs有hsa-miR-106b-5p、hsa-miR-195-5p、hsa-miR-5001-5p、hsa-miR-27a-3p、hsa-miR-130a-3p。結論 miRNAs表達異常在人類GBM中發揮著重要作用,為闡明miRNAs在GBM發生發展過程中的分子機制以及開發靶向治療提供基礎。
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