基于葉綠體DNA atp B-rbc L片段的典型櫻亞屬部分種的親緣關系及分類地位探討
摘要：薔薇科典型櫻亞屬植物(Subg.Cerasus Koehne)(櫻花類)具有重要的觀賞價值,深入研究其種間親緣關系及分類地位,對于國產(chǎn)櫻屬植物系統(tǒng)發(fā)育與種質(zhì)資源創(chuàng)新具有重要的理論指導意義。基于PCR擴增與測序技術研究了從云南、江西、福建采集的典型櫻亞屬3個種(含變種)的葉綠體DNA非編碼區(qū)atp B-rbc L片段,結合GenBank數(shù)據(jù)庫已經(jīng)提交的其它4個種的同源序列,共獲得7個種的30條序列矩陣,以此構建了單倍型中介網(wǎng)絡圖與系統(tǒng)發(fā)育樹,分析和探討了它們的親緣關系與分類地位。(1)在atp B-rbc L序列矩陣中,774個有效位點中共發(fā)現(xiàn)15個多態(tài)性位點,占分析序列的1.94%,(A+T)含量為70.50%,存在明顯的堿基偏好;(2)DNASP 5共檢測到9個單倍型,物種間平均單倍型多樣性(H d=0.880 5±0.026),平均核苷酸多態(tài)性(π=0.007 11±0.000 54),除尾葉櫻桃(Prunus dielsiana)外(Hap5~Hap7),其余物種擁有各自獨特的1個單倍型,具有較豐富的遺傳多樣性;(3)綜合Network中介圖與系統(tǒng)發(fā)育重建結果:推測磐安櫻桃(P.pananensis)處于較原始的進化階段,相比尾葉櫻桃,與浙閩櫻桃(P.schneideriana)親緣關系較近;長柱尾葉櫻桃(P.dielsiana var.longistyla)與尾葉櫻桃互為姊妹支,并共同構成獨立進化單元。綜上,葉綠體atp B-rbc L片段在典型櫻亞屬下種間的適用效果較好,可以優(yōu)先選為DNA條形碼;分子證據(jù)結合形態(tài)學特征支持將長柱尾葉櫻桃作為尾葉櫻桃變種的處理意見,而磐安櫻桃的分類地位則需要更多的證據(jù)。
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