PEG模擬干旱脅迫下野生大豆轉錄組分析
摘要：為研究耐旱型野生大豆在干旱脅迫下基因表達譜的變化,從備選野生大豆材料中篩選抗旱性強的野生大豆品種,同時探討最適PEG脅迫濃度,而后以野生大豆永46為試驗材料,利用RNA-seq技術對20%PEG6000處理不同時間的葉片進行基因表達譜差異分析。結果顯示：獲得39 183個序列信息,其中各時期共有序列27 875個。隨干旱脅迫時間延長,差異表達基因數量發生變化,脅迫12 h達到最多。根據GO功能分析可將序列大致分為分子功能、細胞成分和生物學過程三大類,其差異表達基因廣泛涉及糖、脂類、蛋白質和核酸等生物大分子代謝、能量代謝以及次生代謝過程。在KEGG數據庫中,依據代謝途徑可將其定位在127個分支,包括植物-病原體互作、植物激素信號轉導、RNA降解、ABC轉運蛋白等,其中植物激素信號轉導途徑在不同時間處理下的變化都顯著。轉錄因子分析發現在干旱脅迫下變化明顯的轉錄因子家族包括MYB、bHLH、AP2／EREBP、WRKY和NAC等。對4個不同功能基因干旱脅迫后不同時間的表達量進行熒光定量分析,其變化趨勢與轉錄組數據相同。
注: 保護知識產權,如需閱讀全文請聯系大豆科學雜志社
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