肺鱗癌中miR-144靶基因預測及其生物信息學分析
摘要:目的:分析miR-144靶基因在肺鱗癌中參與的信號通路生物過程。方法:分析The Cancer Genome Atlas網站中肺鱗癌患者的miR-144的表達量及生存曲線;預測miR-144靶基因并通過表達數據篩選影響肺鱗癌進展基因;BinGo軟件對候選靶基因進行GO注釋分析,利用DAVID網站預測其信號通路。結果:miR-144表達量高有利于延長肺鱗癌患者生存時間。綜合4個靶基因數據庫發現miR-144有72個預測結果,其中45個在肺鱗癌患者癌與癌旁組織間表達存在差異。其中部分候選靶基因參與胞核及星形微管的組成,參與上皮細胞增生、RNA合成。通路分析顯示部分候選靶基因參與Ras、Wnt、Hippo等信號通路。結論:45個miR-144候選靶基因通過多條信號通路及生物過程調節細胞生命活動,影響腫瘤患者生存預期。
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