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動物基因組選配方法與應(yīng)用

何俊; Fernando; B.Lopes; 吳曉林 湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)動物科技學(xué)院; 長沙410128; 美國威斯康星大學(xué)動物科學(xué)系; 威斯康星州麥迪遜市53706; 美國紐勤公司生物信息與生物統(tǒng)計(jì)部; 內(nèi)布拉斯加州林肯市68504

摘要:基因組選擇(genomic selection,GS)是利用覆蓋基因組的分子標(biāo)記預(yù)測動物個體的估計(jì)育種值,可以提高選擇的準(zhǔn)確度和選擇強(qiáng)度,縮短世代間隔,做到早選、準(zhǔn)選,使動物育種發(fā)生了巨大變革。過去的10多年間,基因組選擇技術(shù)應(yīng)用于奶牛等動物的育種中,使種用動物的選擇更為準(zhǔn)確,遺傳進(jìn)展得到大幅提高。但基因組選擇通常重視目標(biāo)性狀的遺傳進(jìn)展,而忽略了配種親本個體間的遺傳關(guān)系,因此也沒有考慮到后代群體中近交程度的增加、遺傳多樣性的降低以及有害基因的純合等問題,因此難以維持長期的遺傳進(jìn)展。2016年,一種具有可持續(xù)性的遺傳選擇方法被正式提出,稱為基因組選配(genomic mating,GM)。該方法利用待選種用個體的基因組信息實(shí)施優(yōu)化的選種和選配,可以控制群體近交的增長速率,實(shí)現(xiàn)長期且可持續(xù)的遺傳進(jìn)展。因此基因組選配方法比基因組選擇的方法更適合于現(xiàn)代動物育種,尤其適用于地方品種的保護(hù)和遺傳改良。本文綜述了基因組選配的基本概念、方法和應(yīng)用,并通過模擬的方法比較了6種選配方案的選擇效果,旨在為動物育種方法的應(yīng)用提供參考。

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