母源性長鏈非編碼RNA Six2a-OT參與斑馬魚胚胎發育調控
摘要：Six基因家族進化高度保守,在脊椎動物個體發育中起著重要作用。但目前對其調控機制尚不完全清楚。在UCSC （The University of California Santa Cruz） Genome Browser的斑馬魚基因組數據庫中發現, Six2a-Six3a基因簇周圍存在一條長鏈非編碼RNA——Six2a-OT。首先,利用反轉錄PCR （RT-PCR）結合測序證實了該RNA確實存在。然后,利用熒光半定量PCR （qPCR）和整胚原位雜交（whole-mount in situ hybridization, WISH）確定了其特異性的表達模式：Six2a-OT在卵巢中的表達遠高于精巢;在受精卵和早期原腸胚中高表達,隨后顯著下降;受精后48 h （48 hpf）集中表達于耳囊（otic vesicle）、軀干中線（trunk midline）和鰓弓（branchial archs）。隨后,進一步利用反義嗎啡啉（morpholino）特異性阻斷Six2a-OT剪接,觀察到63%的48 hpf胚胎表現出軀干變短、側彎,或心包積水,同時Six2a和Six3a的表達顯著下降。以上結果表明：Six2a-OT作為母源性因子通過調節Six2a和Six3a的表達參與斑馬魚胚胎早期發育。這為揭示Six基因簇的表達調控機制提供了重要依據。
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