Gateway技術構建菊芋塊莖全長cDNA文庫及EST測序分析
摘要：為豐富菊芋功能基因組學研究基礎平臺,以成熟期菊芋塊莖為材料,將菊芋全長cDNA與Gateway供體載體pDONR222重組,構建了菊芋非剪切型全長cDNA文庫。文庫質量分析表明：未經擴增的原始文庫庫容量為5.76×10 6 CFU,插入片段大小主要為1～3000 bp,重組率為100%（24/24）,達到了高質量文庫的標準。利用該文庫進行表達序列標簽（expressed sequence tag, EST）測序,得到2639條高質量的EST序列,拼接后獲得1895條非重復的唯一表達序列（unigene）。與NCBI的NR數據庫同源比對分析表明,共有1533條unigene（80.9%）與已知基因有顯著的同源性。GO分類結果顯示：菊芋塊莖表達基因在分子功能類群中,結合和催化活性所占比例最高。此cDNA文庫將可用于菊芋功能基因組研究、新基因篩選、高通量EST測序以及菊芋cDNA芯片的制備等。
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