基于RAD測序的枸杞種質研究
摘要：枸杞是一種具有悠久栽培歷史的重要藥食兩用植物。但是由于各種原因,野生枸杞品種與地方品種之間的遺傳關系一直不清楚,這在很大程度上阻礙了現代枸杞育種工作。本研究中,我們收集了19份枸杞種質,并利用RAD標記研究這些種質之間的遺傳關系。測序后共得到了30.32Gb的clean data,平均每個樣本為1.596Gb。平均比對率為85.7%,平均覆蓋深度為6.76x,系統發育結果將所有種質清晰的區分。所有栽培品種都與寧夏枸杞有共同的祖先,這表明寧夏枸杞可能參與了這些地方品種的培育。一些地方品種即“寧杞”系列,“青杞-1”和“蒙杞-1”,得到了系統發育結果的支持,而三倍體枸杞被證明是建立在“寧杞-1”和四倍體枸杞雜交的基礎上的。本研究揭示了枸杞的遺傳背景,為枸杞的物種分類、加入鑒定和保護以及枸杞雜交品種的生產奠定了基礎。
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