多鱗鱚不同組織熒光定量PCR內參基因篩選
摘要:【目的】篩選多鱗鱚(Sillago sihama)雌雄不同組織中穩定表達的內參基因。【方法】應用實時熒光定量PCR(qRT-PCR)技術定量分析多鱗鱚snrpd1、rps27、rpl7a、rpl7、cnpb、rps4、rps20、ef1a、ube2、rplp2等10個候選內參基因m RNA在雌、雄個體腦、鰓、性腺、心、腸、腎、肝、肌肉、皮膚、脾、胃等22個組織中的表達水平,通過BestKeeper、NormFinder、GeNorm工具測評10個內參基因表達的穩定性。【結果】10個候選內參基因均可獲得特異性的擴增產物和理想的擴增效率,其中Bestkeeper軟件計算候選內參基因穩定性由高到低的順序為:snrpd1=rps27〉 rpl7a〉 rpl7〉cnpb=rps4〉 rps20〉 ef1a〉 ube2〉 rplp2;Norm Finder軟件分析結果為:rpl7〉rpl7a〉 rps27〉 rps4〉 cnpb〉 ef1a〉 rps20〉 ube2〉 rplp2〉 snrpd1;Ge Norm軟件分析結果為:rpl7/rpl7a〉 rps4〉ef1a〉 rps27〉 rps20〉 cnpb〉 ube2〉 rplp2〉 snprd1。【結論】rpl7、rpl7a、rps27基因的表達穩定性較高,建議選擇rpl7和rpl7a共同作為多鱗鱚q RT-PCR研究的內參基因。
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