基于核基因和葉綠體基因序列的杏屬系統發育分析——探討洪平杏的起源和親緣關系
摘要：洪平杏(Armeniaca hongpingensis C.L.Li)是杏屬的一個狹域分布種,基于形態觀察被推測為杏(A.vulgaris Lam.)和梅(A.mume Sieb.)的天然雜交種,但目前尚無該種與杏、梅親緣關系的分子系統學研究。本文以洪平杏的成株和實生苗以及包括杏、梅在內的6種(含1變種)杏屬植物為研究材料,分別采用核基因(ITS和SBEI)和葉綠體基因(mat K和ycf 1b)序列構建系統發育樹,并采用mat K、ycf1b和SBEI基因序列構建單倍型網絡圖,探討該物種與杏、梅及杏梅(A.mume Sieb.var.bungo Makino)之間的親緣關系。基于核基因和葉綠體基因序列分別構建的系統發育樹均顯示,洪平杏的成株及其全部實生苗個體單獨聚為一支,且具有較高的支持率(分別為99/79、71/81),獨立于杏屬其他種之外。而基于核基因ITS序列的系統發育分析結果表明,洪平杏除極少數成株與杏、杏梅聚為一支外,其余所有成株與實生苗聚為2大支(支持率分別為0.82和0.97),而沒有克隆的與梅聚在一起。單倍型分析結果表明,該物種的成株與實生苗在SBEI和ycf1b基因序列中均未檢測到杏或梅的單倍型,僅有少數(2/9)的實生苗個體在葉綠體mat K基因序列中檢測到杏的單倍型。研究結果不支持將洪平杏定為杏和梅的天然雜交種的觀點,推測洪平杏應為一個獨立的物種,與杏之間的親緣關系更近并且存在可檢測到的基因流。
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