三帶喙庫蚊中分離的西藏環狀病毒全基因序列測定及分析
摘要:西藏環狀病毒(Tibet orbivirus,TIBOV)是環狀病毒屬中的新成員,首次分離自中國西藏自治區的圓斑按蚊,本研究首次對從三帶喙庫蚊標本中分離到的西藏環狀病毒(HN11121株)進行全基因組序列測定和分子遺傳進化分析。結果顯示除第2節段以外,三帶喙庫蚊分離的HN11121病毒株與從圓斑按蚊分離的西藏環狀病毒原始分離株(XZ0906)第1~10節段核苷酸和其編碼的氨基酸序列長度相同,核苷酸和氨基酸同源性分別為70.3%(S6)~98.7%(S5)和79.8%(S6)~99.8%(S10);而HN11121病毒株與XZ0906病毒株第2節段核苷酸長度分別為2 850bp和2 838bp,分別編碼950和946個氨基酸,核苷酸和氨基酸同源性分別為55.8%和47.1%。病毒VP2蛋白氨基酸位點差異結果顯示從三帶喙庫蚊分離的HN11121病毒與從圓斑按蚊分離的XZ0906相比存在390個氨基酸差異位點。基于HN11121病毒株VP1基因和VP3基因核苷酸序列的系統進化分析結果顯示HN11121屬于環狀病毒屬西藏環狀病毒,但是從三帶喙庫蚊分離的HN11121病毒與在圓斑按蚊分離的西藏環狀病毒原始分離株(XZ0906)處在不同的進化分支。以上結果提示,從三帶喙庫蚊分離的西藏環狀病毒(HN11121)與從圓斑按蚊分離的西藏環狀病毒在病毒基因組和病毒基因組分子遺傳進化均存在較大差異,鑒于三帶喙庫蚊是我國乙腦病毒的主要傳播媒介,同時該蚊種也是我國南方廣泛存在的蚊蟲種類,因此加強三帶喙庫蚊中西藏環狀病毒監測對于了解西藏環狀病毒的生物多態性具有重要意義。
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