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摘要：了解廣東省目前流行的乙型腦炎病毒的基因型別,以及新分離毒株與P3和SA14-14-2疫苗株E蛋白的氨基酸差異,推測(cè)疫苗株的可能保護(hù)效果。本研究對(duì)廣東省2017年從蚊蟲和蠓蟲標(biāo)本分離的10株乙型腦炎病毒基因組序列測(cè)定,利用MEGA軟件登錄GenBank下載乙型腦炎病毒代表株序列并繪制進(jìn)化樹,同時(shí)用ClustalW2軟件與疫苗株進(jìn)行氨基酸同源性比對(duì)和E蛋白的序列分析。10株乙型腦炎病毒均屬基因I型GI-b組,但分別位于2個(gè)不同的、小的進(jìn)化分枝中。10株新分離病毒與P3和SA14-14-2疫苗株的E蛋白氨基酸同源性分別位于97.40%~97.60%和97.20%~97.40%之間。E基因區(qū)段500個(gè)氨基酸中,P3株與新分離乙型腦炎病毒株之間共存在17個(gè)氨基酸位點(diǎn)的差異(包括12個(gè)共同氨基酸的改變),略高于SA14-14-2疫苗株的16個(gè)氨基酸位點(diǎn)變異(包括11個(gè)共同氨基酸的改變)。其中在DI區(qū)的P3和SA14-14-2株分別有1個(gè)和3個(gè)共同氨基酸變異,DⅡ區(qū)各有5個(gè)共同氨基酸改變,DⅢ區(qū)分別有5個(gè)和2個(gè)共同氨基酸改變,結(jié)構(gòu)域之外各有1個(gè)共同氨基酸的變異。絕大多數(shù)變異發(fā)生在非關(guān)鍵位點(diǎn),只在E306和E388處觀察到的氨基酸位點(diǎn)變異與疫苗P3株關(guān)鍵位點(diǎn)的改變有關(guān),這兩個(gè)位點(diǎn)(G306E,E388G)均發(fā)生在DⅢ區(qū),而疫苗SA14-14-2未觀察到關(guān)鍵位點(diǎn)的改變。總之,廣東省流行的乙型腦炎病毒基因型別可能已由Ⅲ型變?yōu)镮型;疫苗SA14-14-2株及P3株與新分離毒株均具有很高的同源性,絕大多數(shù)關(guān)鍵氨基酸位點(diǎn)未發(fā)生變異,對(duì)新分離病毒均具有良好的免疫保護(hù)價(jià)值。

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