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結(jié)核分枝桿菌Rv1860T細(xì)胞表位預(yù)測(cè)及分析

何俊才; 王培東; 周放; 鄭輝; 張露; 項(xiàng)杰; 余曉麗 武漢輕工大學(xué)生物與制藥工程學(xué)院; 湖北武漢430023; 武漢市金銀潭醫(yī)院; 湖北武漢430000

摘要：對(duì)結(jié)核分枝桿菌Rv1860的T細(xì)胞表位進(jìn)行預(yù)測(cè)及分析。從NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)得到Rv1860的蛋白質(zhì)序列,運(yùn)用Blastp分析Rv1860蛋白與人類蛋白的同源性,NetMHCⅡ預(yù)測(cè)分析Rv1860的CD4＋T細(xì)胞抗原表位,SYFPEITHI、NetMHC、BIMAS與IEDB預(yù)測(cè)分析Rv1860的CD8＋T細(xì)胞抗原表位。結(jié)果表明,Rv1860的CD4＋T細(xì)胞抗原表位有24條強(qiáng)結(jié)合肽段,117條弱結(jié)合肽段;CD8＋T細(xì)胞抗原表位有3條結(jié)合性較強(qiáng)的肽段。綜合CD4＋T細(xì)胞和CD8＋T細(xì)胞抗原表位分析,得到1條優(yōu)勢(shì)抗原表位肽段為WLGTANNPV263—271,為進(jìn)一步臨床實(shí)驗(yàn)和結(jié)核病診斷以及疫苗的設(shè)計(jì)打下基礎(chǔ)。

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