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結核分枝桿菌Rv1860T細胞表位預測及分析

何俊才; 王培東; 周放; 鄭輝; 張露; 項杰; 余曉麗 武漢輕工大學生物與制藥工程學院; 湖北武漢430023; 武漢市金銀潭醫院; 湖北武漢430000

摘要：對結核分枝桿菌Rv1860的T細胞表位進行預測及分析。從NCBI數據庫得到Rv1860的蛋白質序列,運用Blastp分析Rv1860蛋白與人類蛋白的同源性,NetMHCⅡ預測分析Rv1860的CD4＋T細胞抗原表位,SYFPEITHI、NetMHC、BIMAS與IEDB預測分析Rv1860的CD8＋T細胞抗原表位。結果表明,Rv1860的CD4＋T細胞抗原表位有24條強結合肽段,117條弱結合肽段;CD8＋T細胞抗原表位有3條結合性較強的肽段。綜合CD4＋T細胞和CD8＋T細胞抗原表位分析,得到1條優勢抗原表位肽段為WLGTANNPV263—271,為進一步臨床實驗和結核病診斷以及疫苗的設計打下基礎。

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