攜帶與非攜帶松材線蟲的松墨天牛miRNA表達(dá)譜比較分析
摘要:【目的】松墨天牛是松樹的重要蛀干害蟲,也是林業(yè)重大外來人侵種松材線蟲的媒介昆蟲。雖然松墨天牛和松材線蟲互作的化學(xué)生態(tài)和分子進(jìn)化機(jī)制受到人們的廣泛關(guān)注,但miRNA等表觀遺傳因子在天牛一線蟲互作中的作用未見報道。【方法】使用illuminaHiSeq 2000平臺進(jìn)行miRNA高通量測序,得到4個攜帶線蟲的天牛miRNA庫和4個未攜帶線蟲的天牛miRNA庫。此外,對鑒定出的miRNA進(jìn)行了差異表達(dá)分析,并對這些miRNA的靶基因進(jìn)行了G O注釋和KEGG通路富集分析。【結(jié)果】在攜帶線蟲的天牛表皮、脂肪體、中腸和氣管樣本中分別鑒定出780、802、6 1 7和762個miRNA;在未攜帶松材線蟲的天牛的不同組織樣本中分別鑒定出784、723、7 1 3和837個miRNA。在攜帶松材線蟲的松墨天牛中,某些已知miRNA表達(dá)量會顯著升高,如miR-14、miR279和miR-312等。差異表達(dá)miRNA的功能大多指向代謝、免疫等方面。【結(jié)論】miRNA在松墨天牛和松材線蟲互作中起著重要的調(diào)控作用。
注: 保護(hù)知識產(chǎn)權(quán),如需閱讀全文請聯(lián)系生物安全學(xué)報雜志社