攜帶與非攜帶松材線蟲的松墨天牛miRNA表達譜比較分析
摘要:【目的】松墨天牛是松樹的重要蛀干害蟲,也是林業重大外來人侵種松材線蟲的媒介昆蟲。雖然松墨天牛和松材線蟲互作的化學生態和分子進化機制受到人們的廣泛關注,但miRNA等表觀遺傳因子在天牛一線蟲互作中的作用未見報道。【方法】使用illuminaHiSeq 2000平臺進行miRNA高通量測序,得到4個攜帶線蟲的天牛miRNA庫和4個未攜帶線蟲的天牛miRNA庫。此外,對鑒定出的miRNA進行了差異表達分析,并對這些miRNA的靶基因進行了G O注釋和KEGG通路富集分析。【結果】在攜帶線蟲的天牛表皮、脂肪體、中腸和氣管樣本中分別鑒定出780、802、6 1 7和762個miRNA;在未攜帶松材線蟲的天牛的不同組織樣本中分別鑒定出784、723、7 1 3和837個miRNA。在攜帶松材線蟲的松墨天牛中,某些已知miRNA表達量會顯著升高,如miR-14、miR279和miR-312等。差異表達miRNA的功能大多指向代謝、免疫等方面。【結論】miRNA在松墨天牛和松材線蟲互作中起著重要的調控作用。
注: 保護知識產權,如需閱讀全文請聯系生物安全學報雜志社