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加急見(jiàn)刊

茶小綠葉蟬CYP 6A14基因的克隆及生物信息學(xué)分析

李良德; 王定鋒; 李慧玲; 張輝; 曾明森; 吳光遠(yuǎn) 福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院茶葉研究所; 福建福安355015

摘要:細(xì)胞色素P450(Cytochrome P450,CYP)是一類超家族基因,該基因?qū)r(nóng)藥具有代謝解毒作用,致使昆蟲產(chǎn)生抗藥性,而CYP6是整個(gè)CYP家族中最重要的一族。本研究從前期獲得的茶小綠葉蟬轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù)中篩選出了CYP6A14基因,通過(guò)RT-PCR對(duì)該基因的序列進(jìn)行了校對(duì),并運(yùn)用一系列相應(yīng)軟件對(duì)該基因的生物信息學(xué)進(jìn)行了分析。RT-PCR結(jié)果表明,所獲得的基因片長(zhǎng)1696bp,其中包含21bp的5′端序列,1467bp的編碼區(qū)序列(編碼488個(gè)氨基酸)和208bp的3′端序列。進(jìn)化樹分析結(jié)果表明,該基因與赤擬谷盜親緣關(guān)系最近,與溫室希蛛的親緣關(guān)系最遠(yuǎn)。氨基酸比對(duì)結(jié)果表明,該基因編碼的氨基酸與其他物種的保守性較差。三級(jí)結(jié)構(gòu)模擬結(jié)果表明,CYP6A14蛋白主要由α螺旋組成。功能域預(yù)測(cè)結(jié)果表明,該基因具有一個(gè)p450蛋白域(Pfam:p450),而無(wú)信號(hào)肽(signal peptides)和跨膜結(jié)構(gòu)(transmembrane structure)。該研究獲得了茶小綠葉蟬CYP6A14基因的核苷酸序列,明確了該基因的基本生物學(xué)信息,為后續(xù)研究茶小綠葉蟬CYP6A14的分子功能奠定了基礎(chǔ)。

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