茶小綠葉蟬CYP 6A14基因的克隆及生物信息學分析
摘要：細胞色素P450(Cytochrome P450,CYP)是一類超家族基因,該基因對農藥具有代謝解毒作用,致使昆蟲產生抗藥性,而CYP6是整個CYP家族中最重要的一族。本研究從前期獲得的茶小綠葉蟬轉錄組數據庫中篩選出了CYP6A14基因,通過RT-PCR對該基因的序列進行了校對,并運用一系列相應軟件對該基因的生物信息學進行了分析。RT-PCR結果表明,所獲得的基因片長1696bp,其中包含21bp的5′端序列,1467bp的編碼區序列(編碼488個氨基酸)和208bp的3′端序列。進化樹分析結果表明,該基因與赤擬谷盜親緣關系最近,與溫室希蛛的親緣關系最遠。氨基酸比對結果表明,該基因編碼的氨基酸與其他物種的保守性較差。三級結構模擬結果表明,CYP6A14蛋白主要由α螺旋組成。功能域預測結果表明,該基因具有一個p450蛋白域(Pfam:p450),而無信號肽(signal peptides)和跨膜結構(transmembrane structure)。該研究獲得了茶小綠葉蟬CYP6A14基因的核苷酸序列,明確了該基因的基本生物學信息,為后續研究茶小綠葉蟬CYP6A14的分子功能奠定了基礎。
注: 保護知識產權,如需閱讀全文請聯系茶葉學報雜志社
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