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青海省東部地區(qū)喜馬拉雅旱獺種群遺傳結(jié)構(gòu)

閆京艷; 林恭華; 陳洪艦; 李千; 覃雯; 蘇建平; 張同作 中國科學(xué)院西北高原生物研究所; 西寧810001; 青海省動物生態(tài)基因組學(xué)重點實驗室; 西寧810001; 中國科學(xué)院大學(xué); 北京100049; 青海省地方病預(yù)防控制所; 西寧811602

摘要:本研究利用11個微衛(wèi)星標記對采自青海省東部地區(qū)的13個喜馬拉雅旱獺(Marmota himalayana)種群149個個體進行基因分型,并運用種群遺傳學(xué)方法對其遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)進行分析。結(jié)果顯示,11個微衛(wèi)星標記位點共計檢測到97個等位基因,各種群的平均觀測雜合度和期望雜合度范圍分別為0.58~0.82和0.60~0.79,種群遺傳多樣性水平相對較高;遺傳結(jié)構(gòu)分析表明,青海省東部地區(qū)的喜馬拉雅旱獺種群具有顯著的遺傳結(jié)構(gòu),13個地理種群形成了3個遺傳聚類群,且3個遺傳聚類群與湟水河和黃河上游干流所劃分的地理單元完全一致,因此我們認為湟水河和黃河上游干流是阻礙該地區(qū)喜馬拉雅旱獺種群進行遷移擴散和基因交流的天然屏障。同時,STRUCTURE分析結(jié)果還顯示3個遺傳聚類群間仍有明顯的基因流,AMOVA分析也顯示3個聚類群間變異百分比為6.60%,僅略高于聚類群內(nèi)種群間的變異(4.51%),而遠低于種群內(nèi)變異水平(88.90%),表明3個聚類群間的分化程度并不是很深。這說明喜馬拉雅旱獺可能通過橋梁或在枯水期等穿越河流進行基因交流。以上結(jié)果為該地區(qū)的旱獺種群監(jiān)控和鼠疫防控提供科學(xué)的理論基礎(chǔ)。

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