多種IncRNA可影響黑色素瘤的發(fā)生和發(fā)展
摘要:目的:通過生物大數(shù)據(jù)挖掘,探討長鏈非編碼RNA(long noncoding RN,lncRNA)與黑色素瘤發(fā)生發(fā)展的關(guān)系.方法:從基因表達綜合數(shù)據(jù)庫中的黑色素瘤mRNA表達譜數(shù)據(jù)集GSE15605中提取出一些lncRNA的表達信息,并分析這些lncRNA與黑色素瘤的關(guān)聯(lián)關(guān)系.結(jié)果:LINC01213,PGM5-AS1,LINC01133和LOC284578共4個lncRNA與黑色素瘤的發(fā)生和轉(zhuǎn)移顯著相關(guān),其中LINC01213,LINC01133和LOC284578的表達可被BRAF基因突變影響,而PGM5-AS1的表達能被NRAS基因突變影響.利用這4個lncRNA的表達值構(gòu)建的預(yù)測模型可較好地區(qū)分正常樣本、初發(fā)黑色素瘤樣本和轉(zhuǎn)移性黑色素瘤樣本.結(jié)論:LncRNA可能在黑色素瘤的發(fā)生和轉(zhuǎn)移中起重要作用.
注: 保護知識產(chǎn)權(quán),如需閱讀全文請聯(lián)系湖南醫(yī)科大學(xué)學(xué)報雜志社