多種IncRNA可影響黑色素瘤的發生和發展
摘要:目的:通過生物大數據挖掘,探討長鏈非編碼RNA(long noncoding RN,lncRNA)與黑色素瘤發生發展的關系.方法:從基因表達綜合數據庫中的黑色素瘤mRNA表達譜數據集GSE15605中提取出一些lncRNA的表達信息,并分析這些lncRNA與黑色素瘤的關聯關系.結果:LINC01213,PGM5-AS1,LINC01133和LOC284578共4個lncRNA與黑色素瘤的發生和轉移顯著相關,其中LINC01213,LINC01133和LOC284578的表達可被BRAF基因突變影響,而PGM5-AS1的表達能被NRAS基因突變影響.利用這4個lncRNA的表達值構建的預測模型可較好地區分正常樣本、初發黑色素瘤樣本和轉移性黑色素瘤樣本.結論:LncRNA可能在黑色素瘤的發生和轉移中起重要作用.
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