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基因芯片篩選7例患兒哮喘基因的研究

萬斯慜 陳凱鵬 蘆愛萍 深圳市羅湖區(qū)人民醫(yī)院兒科 518100

摘要：目的 對7例支氣管哮喘(簡稱哮喘)患兒的差異表達基因進行生物信息學分類.方法 實驗組7例,對照組8例,抽取外周血并分離出淋巴細胞RNA,進行cDNA合成、標記及雜交,通過聚類分析來揭示標本之間可辨識的基因表達譜,最后用GO分析和Pathway分析測定這些差異表達基因的作用.結果 在29 890個基因中,發(fā)現(xiàn)4 725個基因存在差異表達,其中1 660個表達上調,3 065個表達下調.GO分析發(fā)現(xiàn)這些基因在生物學過程、細胞組分及分子功能中存在不同的調節(jié).Pathway 通路分析發(fā)現(xiàn)共有88條通路,其中基因表達上調通路有22條,下調有66條,進一步對這些通路的差異表達基因進行分析,發(fā)現(xiàn)有不少在3條以上的通路富集.結論 實驗組基因表達與對照組相比存在很大差異,這些差異基因涉及多種生物學過程,表明小兒哮喘的發(fā)病是一個復雜的病理生理過程.

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