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谷子分蘗相關(guān)QTL定位及緊密連鎖標(biāo)記開發(fā)

杜曉芬; 王軍; 李云飛; 王智蘭; 袁國保; 杜國華; 韓芳; 彭建祥; 張文娜; 蔡偉; 袁峰; 崔巨多; 郭二虎; 鄒洪鋒; 張林義; 彭書忠 山西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院谷子研究所; 山西省特色雜糧種質(zhì)資源發(fā)掘與育種重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室; 山西長治046011; 華大農(nóng)業(yè)應(yīng)用研究院; 廣東深圳518083; 華大小米產(chǎn)業(yè)股份有限公司; 廣東深圳518083; 延安市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所; 陜西延安716000

摘要:分蘗是與農(nóng)作物產(chǎn)量相關(guān)的重要農(nóng)藝性狀之一,分蘗對(duì)于谷子產(chǎn)量的提高具有重要意義,但是目前谷子分蘗遺傳分子機(jī)制還不清楚。利用簡化基因組測(cè)序技術(shù)(RAD-seq),以2個(gè)F2群體(命名為Cross AJ和Cross HC)為研究對(duì)象,分別對(duì)2個(gè)F2群體的543個(gè)和131個(gè)單株及其親本進(jìn)行RAD-seq,利用MSTmap和WinQTLCart2.5軟件進(jìn)行遺傳圖譜構(gòu)建和QTL分析,結(jié)果共鑒定出8個(gè)控制分蘗相關(guān)的QTL。其中,利用Cross AJ共鑒定了6個(gè)QTL,分別為qAJTN1、qAJTN5、qAJTN7-1、qAJTN7-2、qAJTN7-3和qAJTN9,可解釋表型變異0.7%~9.8%;利用Cross HC群體共鑒定了2個(gè)QTL,分別為qHCTN5和qHCTN7,可解釋表型變異1.4%~8.3%。在這8個(gè)QTL中,qAJTN1、qAJTN5、qAJTN7-2、qAJTN9和qHCTN5為該研究新鑒定的位點(diǎn),其余3個(gè)QTL(qAJTN7-1、qAJTN7-3和qHCTN7)與前人研究結(jié)果相一致。另外,通過將親本的測(cè)序結(jié)果與參考基因組進(jìn)行比對(duì),搜索插入缺失位點(diǎn)InDel(Insertion-deletion),新開發(fā)了谷子分蘗相關(guān)QTL(qAJTN7-3和qHCTN7)緊密相關(guān)的InDel標(biāo)記。結(jié)果為谷子分蘗機(jī)制的研究奠定一定基礎(chǔ),所開發(fā)的分子標(biāo)記對(duì)于分蘗型谷子的分子標(biāo)記輔助育種具有重要意義。

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