谷子分蘗相關(guān)QTL定位及緊密連鎖標(biāo)記開發(fā)
摘要:分蘗是與農(nóng)作物產(chǎn)量相關(guān)的重要農(nóng)藝性狀之一,分蘗對(duì)于谷子產(chǎn)量的提高具有重要意義,但是目前谷子分蘗遺傳分子機(jī)制還不清楚。利用簡化基因組測(cè)序技術(shù)(RAD-seq),以2個(gè)F2群體(命名為Cross AJ和Cross HC)為研究對(duì)象,分別對(duì)2個(gè)F2群體的543個(gè)和131個(gè)單株及其親本進(jìn)行RAD-seq,利用MSTmap和WinQTLCart2.5軟件進(jìn)行遺傳圖譜構(gòu)建和QTL分析,結(jié)果共鑒定出8個(gè)控制分蘗相關(guān)的QTL。其中,利用Cross AJ共鑒定了6個(gè)QTL,分別為qAJTN1、qAJTN5、qAJTN7-1、qAJTN7-2、qAJTN7-3和qAJTN9,可解釋表型變異0.7%~9.8%;利用Cross HC群體共鑒定了2個(gè)QTL,分別為qHCTN5和qHCTN7,可解釋表型變異1.4%~8.3%。在這8個(gè)QTL中,qAJTN1、qAJTN5、qAJTN7-2、qAJTN9和qHCTN5為該研究新鑒定的位點(diǎn),其余3個(gè)QTL(qAJTN7-1、qAJTN7-3和qHCTN7)與前人研究結(jié)果相一致。另外,通過將親本的測(cè)序結(jié)果與參考基因組進(jìn)行比對(duì),搜索插入缺失位點(diǎn)InDel(Insertion-deletion),新開發(fā)了谷子分蘗相關(guān)QTL(qAJTN7-3和qHCTN7)緊密相關(guān)的InDel標(biāo)記。結(jié)果為谷子分蘗機(jī)制的研究奠定一定基礎(chǔ),所開發(fā)的分子標(biāo)記對(duì)于分蘗型谷子的分子標(biāo)記輔助育種具有重要意義。
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