2016—2017年鹽城市手足口病腸道病毒譜構成及CVA10型腸道病毒VP1基因特征
摘要：目的了解2016—2017年鹽城市手足口病腸道病毒譜分布特征,并對鑒定為CVA10型腸道病毒VP1基因進行分子進化特征分析。方法疑似手足口病咽、肛拭子標本,采用實時熒光RT-PCR方法檢測腸道病毒核酸,以RT-PCR法擴增CVA10型VP1基因全長編碼區并進行序列分析,采用相應的生物信息軟件進行核苷酸及氨基酸序列比對及基因種系進化特征分析。結果 2016—2017年鹽城市手足口病原主要以其他腸道病毒為主,其他腸道病毒的流行共有10種基因型,其中CVA6、CVA10型為優勢流行株,占其他腸道病毒陽性的77.03%、13.51%。19株CVA10VP1區核苷酸、氨基酸同源性分別為92.5%-100.0%、97.3%-100.0%。2年間,毒株組內核苷酸同源性分別為96.4%-100.0%、92.5%-100.0%;氨基酸同源性分別為98.0%-100.0%、97.7%-100.0%。遺傳進化樹顯示：鹽城市CVA10代表株屬于C3、C4基因亞群的毒株,鹽城代表株364/JSYC/2017與2014年云南代表株（LC013415）聚集成簇單獨構成C3基因亞群分支,其余18株鹽城代表株屬于C4基因亞群分支,為主流優勢流行株。結論 2016—2017年鹽城市手足病病原由多種基因型的腸道病毒共同流行,CVA10型為其他腸道病毒的優勢流行株。開展CVA10型腸道病毒分子流行病學研究,了解毒株進化變異趨勢,對防控手足口病具有重要意義。
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