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摘要：目的了解2016—2017年鹽城市手足口病腸道病毒譜分布特征,并對(duì)鑒定為CVA10型腸道病毒VP1基因進(jìn)行分子進(jìn)化特征分析。方法疑似手足口病咽、肛拭子標(biāo)本,采用實(shí)時(shí)熒光RT-PCR方法檢測(cè)腸道病毒核酸,以RT-PCR法擴(kuò)增CVA10型VP1基因全長(zhǎng)編碼區(qū)并進(jìn)行序列分析,采用相應(yīng)的生物信息軟件進(jìn)行核苷酸及氨基酸序列比對(duì)及基因種系進(jìn)化特征分析。結(jié)果 2016—2017年鹽城市手足口病原主要以其他腸道病毒為主,其他腸道病毒的流行共有10種基因型,其中CVA6、CVA10型為優(yōu)勢(shì)流行株,占其他腸道病毒陽(yáng)性的77.03%、13.51%。19株CVA10VP1區(qū)核苷酸、氨基酸同源性分別為92.5%-100.0%、97.3%-100.0%。2年間,毒株組內(nèi)核苷酸同源性分別為96.4%-100.0%、92.5%-100.0%;氨基酸同源性分別為98.0%-100.0%、97.7%-100.0%。遺傳進(jìn)化樹顯示：鹽城市CVA10代表株屬于C3、C4基因亞群的毒株,鹽城代表株364/JSYC/2017與2014年云南代表株（LC013415）聚集成簇單獨(dú)構(gòu)成C3基因亞群分支,其余18株鹽城代表株屬于C4基因亞群分支,為主流優(yōu)勢(shì)流行株。結(jié)論 2016—2017年鹽城市手足病病原由多種基因型的腸道病毒共同流行,CVA10型為其他腸道病毒的優(yōu)勢(shì)流行株。開展CVA10型腸道病毒分子流行病學(xué)研究,了解毒株進(jìn)化變異趨勢(shì),對(duì)防控手足口病具有重要意義。

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