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白羽王鴿卵清蛋白關(guān)聯(lián)蛋白Y基因(OVALY)克隆與生物信息學(xué)分析

徐小欽; 杜雪; 李國勤; 張龍; 陶爭榮; 盧立志 浙江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所; 浙江杭州310021; 西華師范大學(xué)生態(tài)研究院; 四川南充637000; 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)動物科技學(xué)院; 江蘇南京210095; 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部農(nóng)產(chǎn)品信息溯源重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室; 浙江杭州310021

摘要：旨在獲得白羽王鴿(Columba livia)卵清蛋白關(guān)聯(lián)蛋白Y基因(OVALY)的cDNA序列,并進(jìn)行生物信息分析。研究結(jié)果顯示:OVALY基因cDNA全長為2068bp,其中5′非編碼區(qū)序列180bp,3′非編碼區(qū)序列720bp,開放閱讀框1164bp,編碼的蛋白分子量約44.19ku,含氨基酸殘基388個(GenBank∶KX230792);與NCBI數(shù)據(jù)庫中朱鹮(Nipponianippon)OVALY基因序列同源性最高(81%),與白尾鷹(Haliaeetusalbicilla)和沙雞(Pteroclesgutturalis)OVALY基因序列的同源性分別為80%和79%。經(jīng)潛在糖基化位點(diǎn)和磷酸化位點(diǎn)預(yù)測分析發(fā)現(xiàn),OVALY蛋白結(jié)構(gòu)中潛在糖基化位點(diǎn)和磷酸化位點(diǎn)分別為4個和22個;經(jīng)CDD(conserved domaindatabase)數(shù)據(jù)庫分析發(fā)現(xiàn),OVALY蛋白具有絲氨酸蛋白酶抑制劑家族的反應(yīng)中心區(qū)域,屬于絲氨酸蛋白酶抑制劑超家族。

注: 保護(hù)知識產(chǎn)權(quán),如需閱讀全文請聯(lián)系浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào)雜志社

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