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基于生物信息學(xué)分析和預(yù)測(cè)人骨肉瘤中Gab2靶向作用的miRNA分子

張蕊; 吳啟洋; 劉紀(jì)明; 郭曉儀; 吳龍火 贛南醫(yī)學(xué)院藥學(xué)院制藥工程教研室; 江西贛州341000; 贛南醫(yī)學(xué)院; 江西贛州341000

摘要：目的:通過生物信息學(xué)軟件分析和預(yù)測(cè)在人骨肉瘤中能夠靶向結(jié)合Gab2的miRNA。方法:首先通過生物信息學(xué)軟件mir Walk 2. 0預(yù)測(cè)可以靶向結(jié)合Gab2的miRNA,然后用miRanda得到Gab2-miRNA的熱力學(xué)穩(wěn)定性評(píng)分和序列保守性評(píng)分。并通過人骨肉瘤miRNA芯片GSE70367得到在人骨肉瘤中差異表達(dá)的miRNA。在生物信息學(xué)軟件打分較高的miRNA中選出差異表達(dá)的miRNA,從而選出人骨肉瘤中能與Gab2結(jié)合的特異性最強(qiáng),穩(wěn)定性最高的miRNA。結(jié)果:mir Walk 2. 0預(yù)測(cè)有22個(gè)miRNA可與Gab2靶向結(jié)合;其中,miR-1236-3p、miR-218-5p與Gab2結(jié)合的穩(wěn)定性和特異性最好;在人骨肉瘤中差異表達(dá)的miRNA有184個(gè),而miR-218-5p的表達(dá)也存在差異性,并且表達(dá)下調(diào)。結(jié)論:在人骨肉瘤中miR-218-5p可能靶向結(jié)合于Gab2,Gab2是miR-218-5p的靶基因。

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