血管內皮生長因子及其受體在人皮膚黑素瘤的組學數據分析
摘要：目的研究血管內皮生長因子(VEGFA、VEGFB)及其受體KDR、FLT1在人皮膚黑素瘤中的基因組學、轉錄組學變異及其與臨床預后的相關性。方法利用TC-GA數據庫,分析VEGFA、VEGFB及其受體KDR、FLT1的基因組學、轉錄組學突變頻譜及其變化與臨床預后的相關性;通過生物信息學篩選其共同相關基因,探索其可能的分子機制。結果在TCGA數據庫同時具備基因組信息和轉錄組信息的287例黑素瘤樣本中.VEGFA基因突變率為5.92%,VEGFB突變率為2.09%,KDR突變率為16.72%,FLT1突變率為12.54%,其突變與黑素瘤患者生存期無明顯關系,轉錄組數據顯示VEGFA mRNA表達上調率為3.48%,VEGFB mRNA表達上調率為3.83%,KDR mRNA表達上調率為2.09%,FLT1 mRNA表達上調率為3.83%,VEGFB表達上調與患者臨床預后顯著相關,表達上調和表達無變化者生存中位數分別為33.9個月和94.91個月(P=6.870e-4),VEGFA和KDR表達上調對患者預后有影響趨勢,但差異無統計學意義。生物信息學分析顯示CMTM1、QKI、BACH1可能是影響VEGFA/B作用的關鍵基因,提示其可能作為抗血管生成治療的靶位點。結論VEGFA、VEGFB及其受體KDR、FLT1在人黑素瘤中存在著拷貝數擴增和表達量的顯著上調,VEGFB的變化與患者臨床預后顯著相關,提示其可能在黑素瘤的血管生成中發揮著重要作用。本研究為臨床黑素瘤的治療提供了有益線索。
注: 保護知識產權,如需閱讀全文請聯系中國皮膚性病學雜志社
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