長期高脂飲食誘導的肥胖小鼠肝臟免疫相關基因的mRNA變化
摘要：目的探討長期高脂飲食對C57BL/6J小鼠肝臟免疫相關基因表達的影響。方法雄性C57BL/6J小鼠分別高脂飼料喂養16周和38周,對照組給予普通飼料,測量體質量與血糖, HE染色檢查肝組織病變情況。提取RNA,由華大基因北京基因組學研究所BGISEQ-500測序平臺進行測序,原始序列數據參照GRCm38/mm10小鼠基因組進行比對和注釋。利用火山圖進行mRNA數據矩陣分析,找出顯著調控的肝臟免疫相關基因,采用實時熒光定量PCR驗證部分改變顯著基因的數據。結果高脂飲食顯著增加小鼠的體質量和血糖, HE染色顯示高脂飲食小鼠肝臟脂質積聚。轉錄組學火山圖顯示,高脂飲食16周,在795個免疫相關基因中有157個免疫相關基因的表達水平顯著變化。高脂飲食38周有235個免疫相關基因顯著變化,然而大多數基因呈上調趨勢。在發生顯著變化的基因中,選擇了6個基因來驗證轉錄組的數據。高脂飲食16周時, CD36和PR結構域蛋白1(PRDM1)顯著上調, CD276顯著下調。高脂飲食38周, CXC趨化因子配體1(CXCL1)、 CD40、甲酰肽受體1(FPR1)均呈現顯著上調。實時熒光定量PCR數據一般都遵循轉錄組數據的趨勢。結論長期高脂飲食的小鼠肝臟免疫相關基因表達水平發生顯著變化。
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