長(zhǎng)期高脂飲食誘導(dǎo)的肥胖小鼠肝臟免疫相關(guān)基因的mRNA變化
摘要：目的探討長(zhǎng)期高脂飲食對(duì)C57BL/6J小鼠肝臟免疫相關(guān)基因表達(dá)的影響。方法雄性C57BL/6J小鼠分別高脂飼料喂養(yǎng)16周和38周,對(duì)照組給予普通飼料,測(cè)量體質(zhì)量與血糖, HE染色檢查肝組織病變情況。提取RNA,由華大基因北京基因組學(xué)研究所BGISEQ-500測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行測(cè)序,原始序列數(shù)據(jù)參照GRCm38/mm10小鼠基因組進(jìn)行比對(duì)和注釋。利用火山圖進(jìn)行mRNA數(shù)據(jù)矩陣分析,找出顯著調(diào)控的肝臟免疫相關(guān)基因,采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR驗(yàn)證部分改變顯著基因的數(shù)據(jù)。結(jié)果高脂飲食顯著增加小鼠的體質(zhì)量和血糖, HE染色顯示高脂飲食小鼠肝臟脂質(zhì)積聚。轉(zhuǎn)錄組學(xué)火山圖顯示,高脂飲食16周,在795個(gè)免疫相關(guān)基因中有157個(gè)免疫相關(guān)基因的表達(dá)水平顯著變化。高脂飲食38周有235個(gè)免疫相關(guān)基因顯著變化,然而大多數(shù)基因呈上調(diào)趨勢(shì)。在發(fā)生顯著變化的基因中,選擇了6個(gè)基因來(lái)驗(yàn)證轉(zhuǎn)錄組的數(shù)據(jù)。高脂飲食16周時(shí), CD36和PR結(jié)構(gòu)域蛋白1(PRDM1)顯著上調(diào), CD276顯著下調(diào)。高脂飲食38周, CXC趨化因子配體1(CXCL1)、 CD40、甲酰肽受體1(FPR1)均呈現(xiàn)顯著上調(diào)。實(shí)時(shí)熒光定量PCR數(shù)據(jù)一般都遵循轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的趨勢(shì)。結(jié)論長(zhǎng)期高脂飲食的小鼠肝臟免疫相關(guān)基因表達(dá)水平發(fā)生顯著變化。
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