丹苘軟膠囊干預大鼠非酒精性脂肪肝細胞模型基因芯片的組學分析
摘要：目的:通過篩選mRNA(Clariom^TM S Assay)芯片及miRNA芯片的顯著差異性基因,預測microRNA相關靶基因,探究丹苘軟膠囊改善肝細胞脂肪代謝的調控機制。方法:提取丹苘軟膠囊灌胃SD大鼠的含藥血清,并對BRL大鼠肝細胞取對數生長期細胞進行實驗,以陰性對照血清做對照,提取細胞總RNAs,采用Clariom S表達譜芯片及microRNA芯片檢測細胞mRNA及miRNA的表達水平。運用生物信息學方法預測miRNA的靶基因,對脂肪代謝相關基因進行富集分析和通路分析。結果:經篩選和預測得到5629個預測靶基因參與20種生物學過程,7種細胞成分,有20種分子作用,神經營養素信號通路、丙型肝炎、PI3K-Akt信號通路被富集;rno-miR-26b-5p、rno-miR-129b-5p、rno-miR-21b-5p為調控網絡中心;IPA數據庫共檢出31個與實驗有關的脂肪代謝基因。結論:丹苘軟膠囊在治療非酒精性脂肪肝(nonalcoholic fatty liver disease,NAFLD)的機制可能與rno-miR-26b-5p、rno-miR-129b-5p、rno-miR-21b-5p,神經營養素信號通路、丙型肝炎、PI3K-Akt信號通路相關性較高。
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