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梅花鹿茸生長(zhǎng)中心軟骨組織差異基因表達(dá)分析

劉美欣; 趙雨; 張梅; 劉宇昕; 胡耀中; 幺寶金 長(zhǎng)春中醫(yī)藥大學(xué)中醫(yī)藥與生物工程研究開發(fā)中心; 長(zhǎng)春130117; 長(zhǎng)春中醫(yī)藥大學(xué)創(chuàng)新實(shí)踐中心; 長(zhǎng)春130117

摘要：旨在研究不同生長(zhǎng)時(shí)期東北梅花鹿茸生長(zhǎng)中心軟骨組織基因表達(dá)變化,為鹿茸快速生長(zhǎng)機(jī)制研究提供理論依據(jù)。采用Illumina測(cè)序技術(shù)和生物信息學(xué)方法對(duì)快速生長(zhǎng)期和骨化期鹿茸生長(zhǎng)中心軟骨組織進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、組裝、比對(duì)和差異基因表達(dá)分析。從快速生長(zhǎng)期和骨化期鹿茸軟骨組織中分別獲得4.47和4.45 Gb的測(cè)序數(shù)據(jù),測(cè)序質(zhì)量值Q 20值分別為98.44和98.05。通過(guò)Trinity軟件組裝,分別獲得39377和37331條組裝序列,平均長(zhǎng)度分別為1138和1143 nt,通過(guò)與蛋白數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)和差異基因表達(dá)分析篩選出調(diào)控鹿茸快速生長(zhǎng)和骨化的差異表達(dá)生長(zhǎng)因子7種,差異表達(dá)轉(zhuǎn)錄因子12種和差異表達(dá)膠原8種。本研究結(jié)果為鹿茸快速生長(zhǎng)及骨化機(jī)制研究提供理論基礎(chǔ)。

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