基于SSR熒光標記的白蠟核心種質構建
摘要：白蠟為中國北方重要的鹽堿地造林樹種,研究其遺傳多樣性,進一步構建核心種質,對白蠟優異種質的篩選及開發利用具有重要作用,為廣泛開展白蠟種質資源的保存評價、挖掘優異基因資源提供核心材料,同時也為白蠟育種提供優良基因資源。本研究運用SSR標記的方法,選取田間表型性狀差異較大的4個白蠟品種華雄、魯蠟5號、金葉白蠟和金枝白蠟,采用聚丙烯酰胺凝膠電泳從500對SSR引物中篩選出擴增條帶清晰、多態性好、擴增穩定的42對引物。從篩選出的每對引物5′端添加熒光標記后,采用毛細管法通過DNA分析儀檢測202個樣品不同等位變異的擴增片段,從42對SSR引物中篩選出17對擴增穩定的引物,建立基于高通量熒光SSR標記的白蠟種質鑒定體系。研究了來自全國22個地區的具有代表性的202份白蠟種質資源的遺傳多樣性,通過R語言包Genetic Subsetter構建出了40份白蠟核心種質。結果表明:選用的17對引物都表現出多態性,共檢測出142個等位變異,平均每對引物等位基因數為8.353個;平均有效等位基因數為3.342;平均多態性信息含量為0.635。可見白蠟屬植物種間變異較大,具有豐富的遺傳多樣性。構建了40份白蠟核心種質,占原始種質的20%,t檢測表明,所構建的核心種質遺傳多樣性豐富,其代表的遺傳多樣性指標與原始種質資源差異不顯著,說明獲得的核心種質資源能夠充分、最大程度地代表原始種質。研究結果為白蠟種質資源的收集、保護、評價及利用提供了寶貴的理論依據和物質基礎。利用17對高效引物構建了白蠟屬植物SSR高通量鑒定體系,構建的40份白蠟核心種質能夠最大程度的代表其遺傳多樣性。
注: 保護知識產權,如需閱讀全文請聯系中南林業科技大學學報雜志社
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