不同擴(kuò)增方法和探針長(zhǎng)度對(duì)植入前單個(gè)卵裂球比較基因組雜交檢測(cè)結(jié)果的影響
摘要:目的 探討不同擴(kuò)增方法和探針長(zhǎng)度對(duì)植入前單個(gè)卵裂球比較基因組雜交(comparativegenomic hybridization,CGH)檢測(cè)結(jié)果的影響,為植入前產(chǎn)前診斷奠定基礎(chǔ)。方法隨機(jī)將20枚植入前6~8細(xì)胞期胚胎卵裂球分為A和B組(各10枚),取1名正常男性外周血20枚淋巴細(xì)胞,分為C和D組(各10枚)作為對(duì)照。A和c組經(jīng)簡(jiǎn)并寡聚核苷酸聚合酶鏈反應(yīng)(degenerate oligonueleotide primedpolymerase chainreaction,DOPPCR)、B和D組經(jīng)多重置換擴(kuò)增(multiple displacement amplification,MDA)分別進(jìn)行全基因組擴(kuò)增(wholegenomeamplification,WGA),用上述全基因組擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行PCR擴(kuò)增TBX1基因2號(hào)外顯子,驗(yàn)證其特異性。將獲得的WGA產(chǎn)物制備成250~750bp和750~2000bp2種不同長(zhǎng)度的探針與正常男性中期染色體核型進(jìn)行雜交,Y染色體性別決定區(qū)(sex—determiningregionofY,SRY)基因驗(yàn)證CGH檢測(cè)結(jié)果。結(jié)果(1)用DOP—PCR擴(kuò)增時(shí),A組10枚卵裂球中有9枚WGA成功,C組10枚淋巴細(xì)胞WGA均成功;但其擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)一步擴(kuò)增TBX1基因2號(hào)外顯子時(shí),出現(xiàn)較多非特異性條帶。CGH檢測(cè)中,5例卵裂球用長(zhǎng)度250~750bp的探針檢測(cè)時(shí),1例失敗,1例CGH軟件核型分析結(jié)果與SRY結(jié)果不一致。(2)經(jīng)MDA的B和D組,均WGA成功;其產(chǎn)物進(jìn)一步擴(kuò)增TBX1基因2號(hào)外顯子時(shí),非特異性條帶少。CGH檢測(cè)中,探針長(zhǎng)度為250~750bp的5例卵裂球均檢測(cè)成功,且與SRY驗(yàn)證結(jié)果一致。(3)用長(zhǎng)度為750~2000bp探針檢測(cè)時(shí),雜交效果不好。結(jié)論單卵裂球全基因組擴(kuò)增,MDA較DOPPcR方法穩(wěn)定,特異性強(qiáng),CGH檢測(cè)中,擴(kuò)增產(chǎn)物酶切至250~750bp制備的探針雜交圖像均勻、清晰,軟件分析核型結(jié)果穩(wěn)定、準(zhǔn)確。
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