絨毛狀煙草和林煙草全長cDNA文庫構建及EST序列分析
摘要：表達序列標簽(EST)廣泛應用于基因功能研究和分子標記開發。以普通煙草兩個二倍體祖先種絨毛狀煙草(Nicotiana tomentosiformis,TT)和林煙草(Nicotiana sylvestris,SS)多個組織為試驗材料,使用CloneMiner cDNA文庫構建方法構建了均一化全長cDNA文庫,測序并進行序列拼接、功能注釋、進化分析和標記開發。絨毛狀煙草和林煙草均一化全長cDNA文庫容量分別為0.72×106和1.12×106 pfu/mL,重組率分別約為94%和93%,插入片段平均長度為1.4 kb。測序獲得20 953條EST序列,拼接為10 504個unigenes。與普通煙草EST序列混合拼接,產生34 450條contigs,123 511條singletons,煙草異源四倍體中T和S基因與絨毛狀煙草、林煙草之間的相似性遠高于兩個二倍體祖先種之間。預測獲得104 915個編碼序列,其中73 670個序列包含功能結構域,81%unigenes在番茄中具有同源基因。鑒定了11 869個微衛星位點(SSR)和25 209個單核苷酸多態性位點(SNP)。這些數據信息對于煙草基因功能研究和分子育種具有重要價值。
注: 保護知識產權,如需閱讀全文請聯系中國煙草科學雜志社
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