利用GBS技術開發煙草SNP標記及遺傳多樣性分析
摘要：研究煙草種質資源的遺傳背景,為煙草種質資源的高效利用提供依據。采用GBS(genotyping-by-sequencing)技術,挖掘92份煙草種質資源的SNP位點,并進行遺傳多樣性和遺傳結構分析。結果表明,測序共獲得了147.165 Gb數據,平均每個樣本1.599 Gb,篩選后共獲得93 685個高質量的SNP位點;不同地理來源煙草群體等位基因數(Na)為1.27~1.93,觀測雜合度(Ho)變化范圍為0.22~0.76,期望雜合度(He)為0.32~0.59,多態性位點數(PLN)范圍為15 877~44 249,多態性位點比率(PPL)為26.61%~74.17%,遺傳多樣性指數(H)為0.19~0.52,遺傳距離(GD)為?0.0148~0.3849。基于遺傳距離的NJ聚類將材料劃分為兩個類群;群體遺傳結構分析表明,本研究所用材料基于模型可劃分為4個亞群。通過GBS技術得到的測序數據量較大且質量較高,群體多態性較高,整體遺傳多樣性偏低,群體結構劃分與種質來源不完全相關。
注: 保護知識產權,如需閱讀全文請聯系中國煙草科學雜志社
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