煙草疫霉SSR分子標記的開發與初步應用
摘要：為開發煙草疫霉的SSR分子標記,利用MISA軟件搜索煙草疫霉基因組序列中的SSR位點,共發現1311個SSR位點,優勢SSR位點為二核苷酸和三核苷酸,分別占總SSR位點的56.45%和39.36%;根據分析到的SSR位點使用Primer 5.0軟件設計48對SSR引物,以7株煙草疫霉的DNA為模板對這些引物進行篩選,共獲得擴增條帶清晰且具有多態性的SSR引物20對,然后使用其中的6對SSR對32株煙草疫霉進行UPGMA聚類分析,遺傳相似系數在0.60~1.00之間,在相似系數0.70水平上,可將其劃分為3個類群,類群Ⅰ包含29個菌株,類群Ⅱ包含1個菌株,類群Ⅲ包含2個菌株,顯示出較低的遺傳分化水平。這些SSR引物的開發將為研究我國煙草疫霉的遺傳多樣性、群體遺傳結構以及遺傳圖譜構建等奠定基礎。
注: 保護知識產權,如需閱讀全文請聯系植物病理學報雜志社
相關推薦
更多
