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煙草疫霉SSR分子標(biāo)記的開發(fā)與初步應(yīng)用

崔林開; 高鵬飛; 劉精精; 康業(yè)斌; 胡艷紅; 趙啟美 河南科技大學(xué)林學(xué)院; 洛陽471023

摘要：為開發(fā)煙草疫霉的SSR分子標(biāo)記,利用MISA軟件搜索煙草疫霉基因組序列中的SSR位點(diǎn),共發(fā)現(xiàn)1311個(gè)SSR位點(diǎn),優(yōu)勢SSR位點(diǎn)為二核苷酸和三核苷酸,分別占總SSR位點(diǎn)的56.45%和39.36%;根據(jù)分析到的SSR位點(diǎn)使用Primer 5.0軟件設(shè)計(jì)48對(duì)SSR引物,以7株煙草疫霉的DNA為模板對(duì)這些引物進(jìn)行篩選,共獲得擴(kuò)增條帶清晰且具有多態(tài)性的SSR引物20對(duì),然后使用其中的6對(duì)SSR對(duì)32株煙草疫霉進(jìn)行UPGMA聚類分析,遺傳相似系數(shù)在0.60~1.00之間,在相似系數(shù)0.70水平上,可將其劃分為3個(gè)類群,類群Ⅰ包含29個(gè)菌株,類群Ⅱ包含1個(gè)菌株,類群Ⅲ包含2個(gè)菌株,顯示出較低的遺傳分化水平。這些SSR引物的開發(fā)將為研究我國煙草疫霉的遺傳多樣性、群體遺傳結(jié)構(gòu)以及遺傳圖譜構(gòu)建等奠定基礎(chǔ)。

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