多位點序列分型技術在熱帶念珠菌中的應用研究
摘要:目的探討上海瑞金醫院臨床分離的熱帶念珠菌MLST (Multilocus sequence types,MLST)型別。方法連續收集上海市瑞金醫院臨床分離的熱帶念珠菌菌株,用PCR技術擴增熱帶念珠菌的6對管家基因,并對擴增片段進行純化測序后與熱帶念珠菌MLST數據庫比對得到臨床菌株的二倍體序列型別DSTs (Diploid sequence types,DSTs),再利用eBURST V3軟件對結果進行分析,用MEGA 6.0軟件建立系統發育樹,最后對部分臨床菌株進行藥物敏感性實驗,探討菌株耐藥與基因型別之間的關系。結果臨床分離的92株熱帶念珠菌分屬于47個DSTs,其中15個DSTs是已經報道的,32個DSTs在本次研究中首次得到;DST507和DST376是本次研究中的優勢型別,且屬于同一個克隆簇。藥敏實驗顯示屬于優勢型別的27株臨床菌株中21株為唑類藥物耐藥菌株。結論 MLST技術是一種高效的基因分型技術;DST507和DST376是上海瑞金醫院熱帶念珠菌的優勢型別;唑類藥物耐藥菌株表現為DST507和DST376的聚集分布。
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