火龍果HuABAR的克隆、生物信息學分析及亞細胞定位
摘要：在前期利用SSH篩選到抗旱相關基因HuABAR的Unigene序列的基礎上,進行了HuABAR的全長cDNA克隆、生物信息學分析及亞細胞定位。結果表明:HuABAR基因cDNA全長為1 239 bp,5′-UTR為264 bp,3′-UTR為414 bp,完整開放閱讀框(ORF)共561 bp,編碼187個氨基酸;生物信息學分析顯示,HuABAR基因編碼蛋白具有典型的SRPBCC結構域,并與PYR1/PYLs(pyrabactin resistance 1/PYR1 like)家族具有較高的相似性;HuABAR在干旱、高溫(42℃)和低溫(4℃)等逆境脅迫下顯著上調表達,并在干旱脅迫5 d、高溫3 d時表達量最高,低溫處理5 d內,表達量持續上升;通過PEG介導法瞬時轉化擬南芥原生質體進行亞細胞定位分析,發現該基因定位于細胞質,與已報道的其他PYR1/PYLs家族基因一致。因此,HuABAR基因可能在火龍果干旱脅迫應答中發揮重要作用。
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