LPS刺激對人結腸癌SW480細胞基因表達的影響
摘要：目的研究結直腸癌細胞炎癥模型中基因表達的變化以及所涉及的信號通路。方法利用脂多糖（LPS）刺激SW480細胞1、3、6小時后提取RNA構建測序文庫進行轉錄組測序,對表達有變化的基因歸類,并進行京都基因與基因組百科全書（Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG）分析,對分析結果進行實時熒光定量PCR驗證。結果發現LPS刺激SW480細胞1、3、6小時后,3個時間點表達均有顯著變化的基因有250個。對這些差異表達的基因進行了KEGG信號通路富集分析發現利用脂多糖刺激構建的炎癥模型里,TNF-α激活和NF-κB信號通路活化最顯著。利用癌癥基因組圖譜（TCGA）數據庫進一步對表達持續上調或下調的基因進行分析發現,部分基因在結腸癌標本中的表達趨勢與LPS刺激結腸癌細胞引起的表達變化趨勢一致。結論在利用脂多糖刺激構建的結腸癌細胞炎癥模型中,炎癥過程中的基因表達變化可能與結腸癌的發生發展密切相關。
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