南移池塘養(yǎng)殖仿刺參腸道菌群結(jié)構(gòu)分析
摘要:本文基于MiSeq高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)南移福建池塘養(yǎng)殖仿刺參(Apostichopus japonicus)腸道菌落結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析。結(jié)果表明,仿刺參前腸(1 C_1)、中腸(1 C_2)和后腸(1C_3)測(cè)得的分類操作單元(OTUs)分別為424、444和414;三組樣品的菌群物種豐度沒有較大差別,但優(yōu)勢(shì)菌種存在較大差異;優(yōu)勢(shì)菌群方面,后腸的優(yōu)勢(shì)菌群為Haliea屬和乳球菌屬(Lactococcus)(分別占后腸總菌數(shù)的11.97%和10.37%),而前腸和中腸的優(yōu)勢(shì)菌群均是乳球菌屬和芽孢桿菌屬(Bacillus),兩者在前腸菌落中的占比分別為27.91%和6.08%,在中腸中的占比分別為33.24%和6.97%。在重復(fù)性方面,三組樣品的菌落組成都有重疊,重疊率為74.35%,其中前腸與中腸相似度較高,菌株種類有90%以上重疊。本文研究為仿刺參腸道益生菌的開發(fā)利用提供基礎(chǔ)資料。
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