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南移池塘養(yǎng)殖仿刺參腸道菌群結(jié)構(gòu)分析

楊求華; 陸振; 林琪; 黃瑞芳; 何麗斌; 葛輝; 周宸; 杜虹 福建省水產(chǎn)研究所; 福建省海洋生物增養(yǎng)殖與高值化利用重點實驗室; 福建廈門361013; 汕頭大學(xué)生物系; 廣東汕頭515063

摘要：本文基于MiSeq高通量測序技術(shù)對南移福建池塘養(yǎng)殖仿刺參（Apostichopus japonicus）腸道菌落結(jié)構(gòu)進行分析。結(jié)果表明,仿刺參前腸（1 C_1）、中腸（1 C_2）和后腸（1C_3）測得的分類操作單元（OTUs）分別為424、444和414;三組樣品的菌群物種豐度沒有較大差別,但優(yōu)勢菌種存在較大差異;優(yōu)勢菌群方面,后腸的優(yōu)勢菌群為Haliea屬和乳球菌屬（Lactococcus）（分別占后腸總菌數(shù)的11.97%和10.37%）,而前腸和中腸的優(yōu)勢菌群均是乳球菌屬和芽孢桿菌屬（Bacillus）,兩者在前腸菌落中的占比分別為27.91%和6.08%,在中腸中的占比分別為33.24%和6.97%。在重復(fù)性方面,三組樣品的菌落組成都有重疊,重疊率為74.35%,其中前腸與中腸相似度較高,菌株種類有90%以上重疊。本文研究為仿刺參腸道益生菌的開發(fā)利用提供基礎(chǔ)資料。

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