廣東省1株百日咳鮑特菌分離株的全基因組測序分析
摘要：目的了解2017年廣東省1株百日咳鮑特菌（簡稱百日咳桿菌）分離株的基因特征。方法對2017年廣東省百日咳桿菌分離株（BP_GD2017）進行全基因組測序，分析這株菌的ptxS1、prn．fim2．fim3等主要抗原基因，并與我國的百日咳桿菌疫苗生產株cs株的抗原基因序列以及GenBank中收錄的百日咳基因序列進行比較分析，同時應用wg-SNPs方法與NCBI上獲取的31株國內外百日咳桿菌的基因組進行遺傳進化分析。結果廣東分離株BP_GD2017的基因組大小為3．64MB，G＋C含量67．74％，rRNA操縱子3個，分別是5S、16S和23S，46個tRNA，基因組結構和特征與我國疫苗生產株cs株以及其他地區和時間分離的百日咳桿菌基因組相似。分離株的ptxSl基因為A型、pm基因為2型，均與我國疫苗生產株cs株不同fim2和fim3基因的氨基酸序列與我國疫苗生產株Cs株同源性為100％。wg-SNPs基因進化顯示與我國疫苗生產株cs株在不同的進化分支，而與近年來流行的其他地區（美國、英國、荷蘭和挪威等地）分離株處于同一進化分支。結論廣東省這株百日咳分離株與我國疫苗生產株cs株的主要抗原基因序列存在一定變異，遺傳進化分支選擇也出現了改變，通過比較分析不同國家或地區的分離株，可以從基因組水平上更加準確地分析基因重紐、突變和進化，可以為制定百目咳疫苗免疫策略以及新型無細胞百日咳疫苗的研發提供支撐。
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