廣東省東莞市腦膜炎奈瑟菌多位點序列分型研究
摘要:目的對東莞市2004—2017年分離的41株腦膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitidis,Nm)進行基因分型研究,了解菌株間的遺傳進化關(guān)系。方法采用多位點序列分型(MLST)技術(shù)、進化分析軟件BioNumerics 7.5及聚類分析軟件eBURST V3對菌株進行核酸序列分析。結(jié)果41株腦膜炎奈瑟菌分為A、B、C、W135四個群,其中1株A群、9株B群、23株C群、8株W135群。共有11個不同STs,分別屬于ST-4821、ST-11、ST-5、ST-41/44克隆群及4個無序列分類(UA),另有1株B群及1株C群菌株無法得到ST型。其中ST-4821 Complex及ST-11 Complex為主要克隆群,分別占61.54%、23.08%。不同血清群其STs/ST-Complex有明顯不同:C群菌株以ST-4821 Complex為主,有ST-4821、ST-4831、ST-4833、ST-5798型,其中ST-4821型有3種基因序列;W135群全為ST-11 Complex,有ST-11和ST-5412型,ST-11集中在2015年分離出的菌株,均同源;A群僅有1株ST-5型;B群較分散。eBURST V3聚類分析發(fā)現(xiàn),東莞市ST-11 Complex基因型相對穩(wěn)定,ST-4821Complex基因型已具遺傳多樣性。結(jié)論東莞市Nm分子型具有基因多樣性,以C群(ST-4821/ST-4821 Complex)和W135群(ST-11/ST-11 Complex)兩大克隆群占絕對優(yōu)勢,B群呈分散狀態(tài)出現(xiàn)在不同的ST克隆群中,可能不同血清群之間已產(chǎn)生莢膜轉(zhuǎn)換,提示B群出現(xiàn)基因重組進化特征。
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