大鼠脊髓損傷后脊髓組織中上調差異基因的生物信息學分析
摘要：目的探究大鼠脊髓損傷后脊髓組織中差異表達的上調基因及功能。方法采用改良Allen法制備雌性Sprague-Dawley大鼠脊髓損傷模型,應用基因芯片技術檢測在大鼠脊髓損傷后脊髓中差異基因的變達,運用基因本體論和基因組百科全書數據庫分析差異上調基因、功能定位與通路。結果脊髓組織總核糖核酸質量檢測結果合格;基因芯片檢測結果顯示上調差異基因1874個,下調差異基因2348個;生物信息學分析上調差異基因的生物學過程、細胞組分和分子功能,涉及凋亡、免疫反應、炎癥等,通路分析主要涉及磷脂酰肌醇三激酶-蛋白激酶B信號通路和Toll樣受體信號通路等。結論脊髓損傷后,上調差異表達基因可能參與脊髓損傷后的繼發性反應,如炎癥、免疫應答、缺氧等,繼而影響脊髓損傷后的運動功能和感覺功能。
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