核糖體蛋白S6激酶β1的分子結構和理化性質分析
摘要:核糖體蛋白S6激酶β1(Ribosomal protein S6 kinaseβ1,RPS6KB1)是一個有價值的肝癌診斷和預后標志物,也是一個潛在的基因治療分子靶點,但其致癌機制和預后價值仍未完全闡明。為了全面認識RPS6KB1,本文使用生物信息學手段,對RPS6KB1蛋白的序列同源性、組織表達、亞細胞定位、理化性質、空間結構及蛋白質相互作用網絡進行分析。結果表明人RPS6KB1基因編碼525個氨基酸組成的多肽,在進化過程中高度保守,屬于PKc_like超家族,是酸性不穩定的親水蛋白,無信號肽和跨膜區域。該蛋白定位于細胞核的可能性最大,主要二級結構為隨機卷曲,存在磷酸化、乙酰化和泛素化位點。與RPS6KB1相互作用的蛋白主要是mTOR信號途徑相關蛋白、PI3K信號途徑相關蛋白、蛋白質合成相關蛋白以及調控胰島素水平相關蛋白。本文結果為進一步研究RPS6KB1的功能及致癌機制提供一定的參考。
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