亞洲棉ARF基因家族全基因組鑒定與分析
摘要：生長素響應因子(ARF)是植物中可以特異性結合生長素應答基因啟動子的轉錄因子,在植物的生長發育中起著重要的調控作用。為了更好的了解亞洲棉中ARF基因家族的種類和數量,本文利用生物信息學的方法,分析了亞洲棉基因組中ARF基因的種類、進化關系、物理定位以及基因的結構和保守基序。結果表明在亞洲棉基因組中發現并初步確定了29個ARF基因,命名為GaARF,通過基因定位發現除在2、3、5、11號染色體上沒有ARF基因外,其他染色體上都有ARF基因存在;而且在10號染色體上還存在著基因簇;進化樹分析表明,亞洲棉部分ARF蛋白和已知功能的擬南芥聚類到一起;表達模式分析顯示,不同組織不同處理條件下ARF基因的表達存在差異。
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