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大豆ω-3和ω-6脂肪酸脫氫酶基因密碼子優(yōu)化

賈雪琦; 左永春 內(nèi)蒙古大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院實(shí)驗(yàn)動(dòng)物研究中心; 呼和浩特010070

摘要：DHA和EPA對(duì)心腦血管疾病以及癌癥等疾病的防治有著重要的作用,其中ω-3和ω-6脂肪酸脫氫酶是合成多不飽和脂肪酸DHA和EPA過程中的兩個(gè)關(guān)鍵的去不飽和酶,由于缺乏這兩種酶的基因,高等動(dòng)物無法自發(fā)合成多不飽和脂肪酸,為了得到可以生產(chǎn)多不飽和脂肪酸的轉(zhuǎn)基因動(dòng)物,本研究計(jì)劃將大豆的這兩個(gè)去飽和脂肪酸作為目的基因,但由于不同物種之間的密碼子使用具有偏愛性,會(huì)嚴(yán)重影響到目的基因在宿主體內(nèi)的表達(dá)水平,為了解決這一問題,提高目的基因在宿主體內(nèi)的表達(dá)水平,同時(shí)采用Jcat在線軟件和手動(dòng)替換密碼子兩種方法對(duì)大豆的ω-3和ω-6脂肪酸脫氫酶基因進(jìn)行了優(yōu)化,然后選出最優(yōu)的優(yōu)化方法,為后期進(jìn)一步的實(shí)驗(yàn)提供目的基因。最后本文預(yù)測了兩種優(yōu)化結(jié)果的RNA二級(jí)結(jié)構(gòu)和CAI、CBI、Nc值和GC含量,比較得出手動(dòng)替換的結(jié)果優(yōu)于在線優(yōu)化的結(jié)果。

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