大豆ω-3和ω-6脂肪酸脫氫酶基因密碼子優化
摘要：DHA和EPA對心腦血管疾病以及癌癥等疾病的防治有著重要的作用,其中ω-3和ω-6脂肪酸脫氫酶是合成多不飽和脂肪酸DHA和EPA過程中的兩個關鍵的去不飽和酶,由于缺乏這兩種酶的基因,高等動物無法自發合成多不飽和脂肪酸,為了得到可以生產多不飽和脂肪酸的轉基因動物,本研究計劃將大豆的這兩個去飽和脂肪酸作為目的基因,但由于不同物種之間的密碼子使用具有偏愛性,會嚴重影響到目的基因在宿主體內的表達水平,為了解決這一問題,提高目的基因在宿主體內的表達水平,同時采用Jcat在線軟件和手動替換密碼子兩種方法對大豆的ω-3和ω-6脂肪酸脫氫酶基因進行了優化,然后選出最優的優化方法,為后期進一步的實驗提供目的基因。最后本文預測了兩種優化結果的RNA二級結構和CAI、CBI、Nc值和GC含量,比較得出手動替換的結果優于在線優化的結果。
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