丙型肝炎病毒E2蛋白的生物信息學(xué)分析
摘要：目的探討研究丙型肝炎病毒E2蛋白的生物學(xué)特征。方法從NCBI數(shù)據(jù)庫中獲取丙型肝炎病毒E2蛋白氨基酸序列,利用在線分析軟件分析其生物學(xué)特征,包括分子式、半衰期、疏水性、跨膜區(qū)、信號肽,磷酸化位點、二級結(jié)構(gòu)特征等,通過綜合分析丙型肝炎病毒E2蛋白的各類性質(zhì),得到最佳抗原表位區(qū)域,并對丙型肝炎病毒E2蛋白氨基酸序列預(yù)測結(jié)果進行了比對分析。結(jié)果丙肝病毒E2蛋白由344個氨基酸組成,分子式為C1696H2543N463O490S21,不穩(wěn)定系數(shù)為35.6,理論等電點為7.2,總體平均親水性為-0.131,為穩(wěn)定性親水蛋白質(zhì),E2蛋白二級結(jié)構(gòu)中主要成分為無規(guī)則卷曲(占比43.6%)。該蛋白無信號肽且無跨膜區(qū),約存在50個磷酸化位點,最佳抗原區(qū)域位于95-100氨基酸位置。結(jié)論生物信息學(xué)方法預(yù)測丙型肝炎病毒E2蛋白屬于穩(wěn)定性親水蛋白,含有抗原表位區(qū)域,可為丙型肝炎表位疫苗的研制提供參考依據(jù)。
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