丙型肝炎病毒E2蛋白的生物信息學分析
摘要：目的探討研究丙型肝炎病毒E2蛋白的生物學特征。方法從NCBI數據庫中獲取丙型肝炎病毒E2蛋白氨基酸序列,利用在線分析軟件分析其生物學特征,包括分子式、半衰期、疏水性、跨膜區、信號肽,磷酸化位點、二級結構特征等,通過綜合分析丙型肝炎病毒E2蛋白的各類性質,得到最佳抗原表位區域,并對丙型肝炎病毒E2蛋白氨基酸序列預測結果進行了比對分析。結果丙肝病毒E2蛋白由344個氨基酸組成,分子式為C1696H2543N463O490S21,不穩定系數為35.6,理論等電點為7.2,總體平均親水性為-0.131,為穩定性親水蛋白質,E2蛋白二級結構中主要成分為無規則卷曲(占比43.6%)。該蛋白無信號肽且無跨膜區,約存在50個磷酸化位點,最佳抗原區域位于95-100氨基酸位置。結論生物信息學方法預測丙型肝炎病毒E2蛋白屬于穩定性親水蛋白,含有抗原表位區域,可為丙型肝炎表位疫苗的研制提供參考依據。
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