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丙型肝炎病毒E2蛋白的生物信息學(xué)分析

李滾; 張?zhí)鹛? 李蓓; 張濤; 盧香香 西安工業(yè)大學(xué)電子信息工程學(xué)院生物醫(yī)學(xué)工程系; 陜西西安710021

摘要：目的探討研究丙型肝炎病毒E2蛋白的生物學(xué)特征。方法從NCBI數(shù)據(jù)庫中獲取丙型肝炎病毒E2蛋白氨基酸序列,利用在線分析軟件分析其生物學(xué)特征,包括分子式、半衰期、疏水性、跨膜區(qū)、信號(hào)肽,磷酸化位點(diǎn)、二級(jí)結(jié)構(gòu)特征等,通過綜合分析丙型肝炎病毒E2蛋白的各類性質(zhì),得到最佳抗原表位區(qū)域,并對丙型肝炎病毒E2蛋白氨基酸序列預(yù)測結(jié)果進(jìn)行了比對分析。結(jié)果丙肝病毒E2蛋白由344個(gè)氨基酸組成,分子式為C1696H2543N463O490S21,不穩(wěn)定系數(shù)為35.6,理論等電點(diǎn)為7.2,總體平均親水性為-0.131,為穩(wěn)定性親水蛋白質(zhì),E2蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)中主要成分為無規(guī)則卷曲(占比43.6%)。該蛋白無信號(hào)肽且無跨膜區(qū),約存在50個(gè)磷酸化位點(diǎn),最佳抗原區(qū)域位于95-100氨基酸位置。結(jié)論生物信息學(xué)方法預(yù)測丙型肝炎病毒E2蛋白屬于穩(wěn)定性親水蛋白,含有抗原表位區(qū)域,可為丙型肝炎表位疫苗的研制提供參考依據(jù)。

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