綠豆SSR標記的開發及遺傳多樣性分析
摘要：SSR標記以其數量豐富、多態性好、共顯性遺傳等優點在基礎研究和育種工作中發揮了重要作用,但目前綠豆基因組中的SSR標記依然較少。本研究將磁珠富集法和測序技術相結合高通量檢測綠豆基因組SSR位點,鑒定出3,275,355個SSR位點,開發了2742個SSR標記。選取其中157個SSR進行PCR驗證,發現有90個(57.33%)標記在10份材料中表現出多態性。挑選40個條帶清晰、多態性高、染色體上均勻分布的標記對90份綠豆資源進行遺傳多樣性分析,單個位點檢測到的等位變異數為2~8個,平均為3.0個,有效等位基因數為1.31~4.21個,平均為2.16。Nei’s基因多樣性指數在0.23~0.76之間,平均為0.51。多態性信息含量為0.22~0.72,平均為0.43。聚類分析將90份材料分為2個類群,包含4個組。第I組主要由北方資源組成,第Ⅱ組種質來源較為分散,第Ⅲ組主要由山東的資源構成,第Ⅳ組包含多數河北的種質資源。本研究開發的多態性SSR標記不僅可以用于綠豆種質資源的遺傳多樣性分析,也將在高密度遺傳圖譜構建、基因定位和分子標記輔助育種中發揮重要作用。
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