綠豆SSR標記的開發(fā)及遺傳多樣性分析
摘要:SSR標記以其數(shù)量豐富、多態(tài)性好、共顯性遺傳等優(yōu)點在基礎(chǔ)研究和育種工作中發(fā)揮了重要作用,但目前綠豆基因組中的SSR標記依然較少。本研究將磁珠富集法和測序技術(shù)相結(jié)合高通量檢測綠豆基因組SSR位點,鑒定出3,275,355個SSR位點,開發(fā)了2742個SSR標記。選取其中157個SSR進行PCR驗證,發(fā)現(xiàn)有90個(57.33%)標記在10份材料中表現(xiàn)出多態(tài)性。挑選40個條帶清晰、多態(tài)性高、染色體上均勻分布的標記對90份綠豆資源進行遺傳多樣性分析,單個位點檢測到的等位變異數(shù)為2~8個,平均為3.0個,有效等位基因數(shù)為1.31~4.21個,平均為2.16。Nei’s基因多樣性指數(shù)在0.23~0.76之間,平均為0.51。多態(tài)性信息含量為0.22~0.72,平均為0.43。聚類分析將90份材料分為2個類群,包含4個組。第I組主要由北方資源組成,第Ⅱ組種質(zhì)來源較為分散,第Ⅲ組主要由山東的資源構(gòu)成,第Ⅳ組包含多數(shù)河北的種質(zhì)資源。本研究開發(fā)的多態(tài)性SSR標記不僅可以用于綠豆種質(zhì)資源的遺傳多樣性分析,也將在高密度遺傳圖譜構(gòu)建、基因定位和分子標記輔助育種中發(fā)揮重要作用。
注: 保護知識產(chǎn)權(quán),如需閱讀全文請聯(lián)系作物學報雜志社